Tag: statystyka do doktoratu

Statystyka medyczna do prac naukowych

 

Studenci oraz doktoranci przygotowujący się do obrony pracy dyplomowej powinni rozważyć możliwość skorzystania z usług statystycznych dedykowanych medycynie. Wnioski z badań statystycznych stanowią doskonałe uzupełnienie części teoretycznej doktoratu.

 

Analizy prowadzone na własną rękę są jednak obarczone sporym ryzykiem błędów oraz wymagają poświęcenia bardzo dużej ilości wolnego czasu. Dlatego też decyzja o skorzystaniu z oferty firmy badawczej może okazać się strzałem w dziesiątkę.

 

Statystyka medyczna – jakie analizy warto przeprowadzić?

 

W celu przygotowania opracowania na potrzeby pracy doktorskiej zazwyczaj wystarczające jest wykonanie podstawowych testów opisowych oraz porównawczych. Najczęściej wykonywane są w tym zakresie analizy korelacyjne oraz testy istotności statystycznej. Nie znaczy to jednak, że prowadzenie obliczeń z wykorzystaniem pozostałych testów parametrycznych oraz nieparametrycznych jest pozbawione sensu.

 

Mając na uwadze specyfikę nauk medycznych, warto rozważyć zwłaszcza możliwość zastosowania:

 

  1. Testów przeżywalności;
  2. Testów ewolucyjnych,
  3. Analiz koszykowych;
  4. Analiz z wykorzystaniem modeli regresji;
  5. Analiz wariancji.

 

Analizy danych: konsultacje i usługa korekty

 

Profesjonalne firmy badawcze, takie jak Biostat, świadczą pomoc statystyczną w zakresie analizy danych już od etapu projektowania założeń metodologicznych. Zapewniają odpowiedni dobór próby badawczej, a także metod i testów analitycznych. Poza tym oferują usługę korekty obliczeń wykonanych przez inne osoby lub podmioty, a także konsultacji dotyczących dowolnie wybranego obszaru analizy statystycznej.

 

Automatyczne obliczenia statystyk medycznych

 

Decydując się na wybór firmy zajmującej się statystyką do doktoratu czy pracy magisterskiej, warto dowiedzieć się wcześniej, czy dysponuje ona nowoczesną platformą analityczną, przystosowaną do prowadzenia obliczeń statystycznych w sposób całkowicie zautomatyzowany. Powinna być ona także wyposażona w moduł intuicyjnego kodowania danych oraz ich walidacji. Poza tym wysokiej jakości oprogramowanie statystyczne umożliwia sporządzanie cyklicznych kopii zapasowych (Date Backup), dzięki czemu udaje się zniwelować ryzyko utraty cennych danych.

 

Jak wybrać najlepszą firmę?

 

Ściśle statystyką medyczną zajmuje się jedynie kilka firm badawczych na rynku, spośród których największym doświadczeniem może się pochwalić agencja Biostat. Jest to firma specjalizująca się w wykonywaniu analiz statystycznych dla farmacji i ośrodków medycznych, która funkcjonuje już od 15 lat w branży. Co istotne, zatrudnia ona doświadczonych statystyków i analityków, którzy mieli okazję współpracować z największymi koncernami farmaceutycznymi w kraju i za granicą.

 

Podsumowanie

 

Nie warto zatem zajmować się prowadzeniem analiz statystycznych do doktoratu na własną rękę. Wówczas jesteśmy bowiem narażeni na spore ryzyko błędów, co na pewno nie zadowoli promotora ani recenzenta. Dlatego też zlecenie zadania wykonania obliczeń zewnętrznej firmie badawczej jest najbardziej optymalnym spośród wszystkich rozwiązań. 

Analiza statystyczna (cz. 2) - obliczanie ryzyka względnego za pomocą R

W poprzednim artykule omawialiśmy ryzyko względne, które jest wygodną wielkością stosowaną w statystyce medycznej informującą w jaki sposób czynnik ryzyka wpływa na szeroko pojmowane wystąpienie zmian patologicznych. W sieci znajdziemy bogate oprogramowanie online pozwalające liczyć interesujące relacje np.  relativeriskcalculatordostępny pod adresem:

https://www.medcalc.org/calc/relative_risk.php.

 

Jednak najczęściej istnieje potrzeba obliczenia szeregu wielkości stosowanych w badaniach klinicznych, czy medycznej analizie statystycznej - wtedy z pomocą przychodzi środowisko programistyczno-obliczeniowe R. Sam program R nie dysponuje wbudowanymi funkcjami pozwalającymi na przeprowadzanie różnorakich klinicznych testów statystycznych: należy ściągnąć odpowiedni pakiet, w tym przypadku najlepszym wyborem jest epitools dostępny między innymi na stronie https://cran.r-project.org/web/packages/epitools/index.html warto zaznaczyć, że epitools znajdziemy również w wersji mobilnej (android):

https://play.google.com/store/apps/details?id=com.epi.function

 

I. Szacowanie ryzyka względnego bez użycia pakietów.

 

1. Należy utworzyć macierz danych. W przypadku szpiczaka mnogiego i promieniowania kod będzie następujący:

 

Proba<- matrix(c(130, 1870, 70, 8000), nrow = 2)	

 

2. Aby kod był przejrzysty- warto nadać nazwy wierszom i kolumnom:

 

	
dimnames(Proba) <- list("Grupa" = c("Myelomamultiplex","Kontrolna"), "MI" = c("Nar.naprom.","Nie nar. na prom."))

 

Grupa               Nar.na prom. Nie nar. na prom.
Myelomamultiplex          130                70
Kontrolna                 1870              8000

 

3. Kolejnym krokiem jest utworzenie tabeli procentowej (np. 130 przypadków szpiczaka dla 200 obserwcji ogółem stanowi 65% -> 0,65):

 

prob.nazw<- prop.table(Proba, margin = 1)

Grupa Nar.na prom. Nie nar. na prom.
Myelomamultiplex 0.650000 0.350000
Kontrolna 0.189463 0.810537

 

4. Ostatnim z kroków pozwalających ocenić ryzykow względne jest zastosowanie poniższej procedury:

 

ryzyko.wg<- prob.nazw[1,1]/prob.nazw[2,1]
3.430749

II. Ocena ryzyka względnego za pomocą pakietu epitools:

 

1. Instalacja i uruchomienie pakietu epitools

>install.packages("epitools")
>library("epitools")	

 

W tym przypadku rozważane będą inne dane

 

2. Utworzenie macierzy danych:

dane <- matrix(c(4,16,40,168),byrow=TRUE,nrow=2)	

 

3. Wywołanie instrukcji epitab(dane_badane,metoda):

epitab (dane,method="riskratio")

 

4. Wynik:

## $dane
## Outcome
## Predictor Disease1 p0 Disease2 p1 riskratio lower upper
## Exposed1 4 0.2000000 16 0.8000000 1.000000 NA NA
## Exposed2 40 0.1923077 168 0.8076923 1.009615 0.8030206 1.269361
## Outcome
## Predictor p.value
## Exposed1 NA
## Exposed2 1

 

RR odczytujemy z kolumny riskratio (1.009615).

 

Dodatkowo można oliczyć logarytm z RR:

 

RR <- prob.nazw[1,1]/prob.nazw[2,1]
log(RR)
1.232779

 

 

III. Obliczenie ryzyka względnego w programie MS Excel 2010

Mając tabelę:

 

Narażony na promieniowanie jonizujące

Nie narażony na promieniowanie

jonizujące

Ogółem

Wystąpienie szpiczaka mnogiego (Myelomamultiplex)

130

70

200

Grupa kontrolna

1870

7930

9800

 

2000

8000

1000

 

Należy najpierw przekonwertować ją do postaci procentowej - pytamy np. ile procent zachorowań jest zależne od promieniowania.

 

Obliczenia przeprowadza się wg następującego wzorca:

 

X=130*1/200, oraz Y=1870*1/9800

 

Następnie dzieląc X/Y otrzymujemy ryzyko względne = 3,406.

 

Autor opracowania: Jeremiasz Pilarz (BioStat)

Biostat. More than statistics.

ul. Kowalczyka 17
44-206 Rybnik

Tel: (+48) 32 42 21 707
Tel. kom.: (+48) 668 300 664
e-mail: biuro@biostat.com.pl

Sondaże Analizy danych